An der Medizinischen Fakult?t der Universit?t Augsburg suchen wir am Lehrstuhl für die Erforschung umweltbezogener Wirkmechanismen auf die Gesundheit zur Verst?rkung unseres interdisziplin?ren Forschungsteams zum n?chstm?glichen Zeitpunkt eine/einen

Bioinformatikerin / Bioinformatiker (m/w/d)
Schwerpunkt Mikrobiom-, Metabolom- und Multi-Omics-Analyse

im Umfang der regelm??igen Arbeitszeit (40h/Woche) in einem auf zun?chst drei Jahre befristeten Besch?ftigungsverh?ltnis. Diese Stelle ist im Rahmen des Projekts BIOMEX (Integrative Bioinformatik zur Ableitung von Risikosignaturen und Pr?ventionsstrategien entlang der Darm-Gehirn-Achse) zu besetzen. Die Vergütung erfolgt bei Vorliegen der pers?nlichen und tariflichen Voraussetzungen nach Entgeltgruppe 13 TV-L.

Der Lehrstuhl ist Teil des interdisziplin?ren Forschungsschwerpunkts Environmental Health Sciences (EHS), der sich mit den gesundheitlichen Auswirkungen von Umwelt- und Ern?hrungsfaktoren befasst. Unser Forschungsfokus liegt auf der mechanistischen Untersuchung umweltbedingter Krankheitsrisiken und der Entwicklung pr?ventiver Ans?tze. Im Zentrum steht dabei die Darmbarriere sowie ihre Bedeutung für Erkrankungen entlang der Darm-Gehirn-Achse, insbesondere neurodegenerativer und neuropsychiatrischer Krankheitsbilder wie Parkinson oder Depression. Hier kooperieren wir national und international mit verschiedenen Disziplinen und setzen als Teil eines multidisziplin?ren Expertenteams an der Universit?t Augsburg zus?tzliche, neue Impulse in der studentischen Lehre im gro?en Kontext von ?Mensch, Klima und Umwelt“.

Ihre Aufgaben:

• Qualit?tskontrolle, Aufbereitung und Analyse von Shotgun-Metagenomdaten sowie weiteren Omics-Daten inkl. Exposomdaten (insbesondere chemical exposomics)
• Erstellung u. a. von Mikrobiom-Funktionsprofilen
• Integration biologischer Marker (z. B. Leaky-Gut-Parameter) mit klinischen, ern?hrungs- und lebensstilbezogenen Daten
• Qualit?tsgesicherter Aufbau und Pflege pseudonymisierter Forschungsdatenbanken einschlie?lich dokumentierter, reproduzierbarer Analysepipelines
• Durchführung multivariater Analysen, Clusterverfahren und Machine-Learning-Methoden zur Subgruppenbildung und Identifikation krankheitstypischer Signaturen
• Einsatz und Weiterentwicklung erkl?rbarer KI-Methoden für pr?diktive Analysen
• Ergebnisvisualisierung, Dokumentation und Aufbereitung für wissenschaftliche Publikationen
• Enge Zusammenarbeit mit interdisziplin?ren Partnern aus Medizin und Grundlagenforschung
• Mitarbeit in der studentischen Lehre

Ihr Profil:

• Abgeschlossenes Studium und Promotion in Bioinformatik, Datenwissenschaft, Biostatistik oder verwandten Bereichen
• Fundierte Erfahrung in der Analyse metagenomischer Daten sowie Multi-Omics-Daten aus dem humanen Kontext
• Sehr gute Kenntnisse in Statistik, multivariaten Verfahren, Clustering und Machine Learning
• Erfahrung mit pr?diktiven Modellen, Modellvalidierung und/oder erkl?rbarer KI ist von Vorteil
• Sicherer Umgang mit Python und/oder R
• Strukturierte, selbst?ndige Arbeitsweise und gute Teamf?higkeit
• gute Deutsch- sowie Englischkenntnisse in Wort und Schrift

Die erforderliche Qualifikation ist bereits in den Bewerbungsunterlagen durch entsprechende Zeugnisse nachzuweisen.

Wir bieten:

• Mitarbeit in innovativen, interdisziplin?ren Forschungsprojekten mit hoher gesellschaftlicher Relevanz
• Ein engagiertes, kollegiales und international vernetztes wissenschaftliches Umfeld
• Aktive Mitwirkung an Publikationen, Konferenzen und Pr?sentationen
• Zugang zu moderner Recheninfrastruktur und bioinformatischen Ressourcen
• M?glichkeit zur Habilitation
• Attraktive Arbeitsbedingungen an einem dynamisch wachsenden Forschungsstandort

Bewerbung & Kontakt:

Bitte senden Sie Ihre Bewerbungsunterlagen (Motivationsschreiben, Lebenslauf, Zeugnisse, Publikationsliste) in Form einer einzigen PDF-Datei mit dem Betreff ?Bewerbung als Bioinformatiker*in“ bis sp?testens

22. April 2026

an Prof. Dr. Evelyn Lamy, E-Mail: exposom-stellen@med.uni-augsburg.de (Stichwort: BI)